联合国大学的研究人员利用计算机建模来研究罕见的行为

2020年7月21日,星期二
金斯伯里大厅

主要研究的研究人员发现了一种基于rna的病毒的新途径,其中抑制剂, 比如医学治疗, 解开. 这一发现可能有助于理解这些抑制剂如何起作用,并可能有助于开发新一代针对高死亡率病毒的药物, 像hiv - 1, Zika病毒, 埃博拉和SARS-CoV2, 导致COVID-19的病毒.

“当我们刚开始这项研究时, 我们从来没有预料到我们会处于一场由RNA病毒引起的大流行之中,哈里什·瓦希什说, 大学副教授 化学工程. “但随着这些类型的病毒的出现,我们的发现将有望加深对病毒rna如何与抑制剂相互作用的理解,并用于设计更好的治疗方法。.”

类似于人类是由一系列不同的染色体组成的, 称为DNA, 许多病毒都有RNA分子的基因组成. 这些基于rna的基因组包含抑制剂可以附着和灭活病毒的潜在位点. 药物开发的部分挑战可能是病毒基因组的波动,这可能会阻止抑制剂的附着.

“当我们刚开始这项研究时, 我们从来没有预料到我们会处于一场由RNA病毒引起的大流行之中."

在他们的 , 最近发表在《永利app新版本官网地址》上, 研究人员专门研究了HIV-1病毒的RNA片段及其与配体/抑制剂的相互作用, 一种已知能干扰病毒复制过程的复杂化合物.

使用计算机建模, 研究人员在几个罕见的事件中发现了抑制剂与病毒RNA解除结合的途径,这些事件意外地显示了RNA构建块结合口袋的许多部分的协调运动. 科学家们把重点放在HIV-1 RNA基因组的结构元素上,因为它们被认为是研究各种RNA病毒相同过程的一个很好的模型. 研究人员在分子水平上模拟了结合/解结合过程中罕见的结构和构象行为,这些行为在实验室中通常很难用实验方法观察到.

“我们观察到在抑制剂结合/解除结合过程中涉及的罕见碱基翻转事件,这为该过程的潜在机制提供了新的细节,瓦希施说. “我们的希望是,这为传统上专注于静态生物分子结构的领域增加了新的可能性,并带来了新的药物.”